ChromasPro是一款免费的DNA测序项目管理软件,为用户提供了多种分析序列所需工具,可以从多个程序和文件类型导入序列的详细信息,支持编辑数据以提高序列组装。采用峰图的转换模式对基因变化的点、线、区域进行直观的分析。
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则较多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图辅助,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
通过精确匹配或较优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro DNA序列分析软件
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图辅助,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
通过精确匹配或较优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
ChromasPro is suitable for DNA sequence assembly projects up to a few megabases, and basic sequence editing and analysis. It is able to assemble data from Sanger sequencers such as ABI, and 454 and Illumina next-generation sequencers, with up to 1,000,000 sequences if 8 Gb RAM is available. ChromasPro has the following features:
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
使用参考序列作为组装的支架。
生成限制位点和片段图,并列出切割,非切割和片段。
映射开放阅读框,由G+C框架图辅助,并用一次点击翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,和开放阅读框架图。
通过NCBI网站进行核苷酸和蛋白质BLAST搜索。
与ClustalW接口执行多个对齐。
反向互补序列和色谱图。
通过精确匹配或较优对齐搜索序列。
编辑核苷酸序列时显示翻译。
进行反向翻译并绘制核苷酸简并。
绘制蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱切片的图像,粘贴到文档或演示文稿中。
系统需求
Compatible with Windows XP, Vista, 7, 8, 10.
Perform multiple alignments by interfacing with ClustalW.
Reverse & complement sequences and chromatograms.
Search for sequences by exact matching or optimal alignment.
Display translations when editing nucleotide sequences.
Perform reverse translations and plot nucleotide degeneracy.
Plot hydrophilicity and antigenicity of proteins.
Copy an image of a chromatogram section for pasting into documents or presentations.
ChromasPro是一款好用的DNA测序图谱软件,软件主要适用于专业的生物学人员使用,软件适用于测序的项目可以高达几百万碱基,并拥有实用的基本序列编辑、序列分析、生成限制位点和片段图以及搜索序列等多种功能,是您进行专业研究的好帮手。
以应用生物系统、Staden色谱图(SCF)、MegaBace (esd)、FASTA、EMBL、GenBank、SwissProt,、GenPept、GCG RSF和纯文本格式打开和保存序列。
将重叠序列组装一致,自动显示含糊不清的序列并编辑。
用高质量数据自动消除低质量序列并提高序列集合。
查看检测基因型文件。
生成限制位点和片段图,并且列举切割、无切割和片段。
染色体图开放阅读框,借助G+C框架图,点击一下即可翻译ORFs。
打印色谱图,限制位点和片段图,并且打开阅读框架图。
执行核苷和蛋白质BLAST,通过NCBI网站搜索。
通过ClustalW的界面执行多序列。
逆向&补充序列和色谱图。
通过准确匹配或较佳队列搜索序列。
当编辑核苷酸系列时显示翻译。
执行反向翻译和标出核苷酸退化。
划分蛋白质的亲水性和抗原性。
复制色谱图截面的图形粘贴到文档或演示文件中。
ChromasPro适用于DNA序列组装项目,可达到几兆字节,并进行基本序列编辑和分析。它能够从Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中组装数据,如果有8GB的可用内存,则较多可组装1,000,000个序列。
ChromasPro具体功能
打开Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和纯文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用图形界面组装重叠序列,生成一致性并突出模糊性进行编辑。
使用高质量数据自动去除低质量序列以改进序列组装。
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